Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-Eb1P04230 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms