Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01672 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01672 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01672 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01672 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms