Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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