Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns1O88456 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capns1O88456 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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