Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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