Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xirp1O70373 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms