Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3aO70157 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Top3aO70157 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3aO70157 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3aO70157 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3aO70157 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms