Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RngttO55236 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RngttO55236 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms