Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ldb2O55203 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ldb2O55203 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ldb2O55203 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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