Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja1O55176 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Pja1O55176 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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