Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb3O54890 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms