Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb10O35955 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb10O35955 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms