Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sp100O35892 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sp100O35892 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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