Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cops5O35864 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cops5O35864 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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