Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TnxbO35452 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TnxbO35452 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TnxbO35452 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms