Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms