Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NmiO35309 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmiO35309 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmiO35309 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmiO35309 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmiO35309 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmiO35309 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NmiO35309 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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NmiO35309 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmiO35309 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmiO35309 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmiO35309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmiO35309 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms