Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RrhO35214 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RrhO35214 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RrhO35214 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RrhO35214 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms