Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms