Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2-Q1O19441 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms