Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EllO08856 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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EllO08856 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EllO08856 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EllO08856 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
EllO08856 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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EllO08856 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EllO08856 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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