Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn1O08788 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn1O08788 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms