Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms