Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2888K7N746 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms