Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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