Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm2035J3QP87 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms