Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c2J3QNM1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms