Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6408J3QNG1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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