Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20918J3QN17 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms