Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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