Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3336J3QMQ6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3336J3QMQ6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3336J3QMQ6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3336J3QMQ6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3336J3QMQ6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3336J3QMQ6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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