Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sclt1G5E861 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms