Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrna9G3X8Z7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms