Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34aG3UW52 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms