Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms