Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LctF8VPT3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LctF8VPT3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms