Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28048F7BCN0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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