Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm17175E9Q528 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms