Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap46E9Q2C0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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