Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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