Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20425E9Q035 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20425E9Q035 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm20425E9Q035 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms