Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms