Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms