Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsf1E9PWW9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsf1E9PWW9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms