Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MccE9PWI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms