Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms