Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh8D3Z6W3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms