Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms