Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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