Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce3B5KM66 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce3B5KM66 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms